一、兩者征管稅種不同：

國稅系統(tǒng)負(fù)責(zé)征收管理的稅種?

1、增值稅；

2、消費(fèi)稅；

3、進(jìn)口產(chǎn)品增值稅；

4、鐵道、各銀行總行、保險總公司集中繳納的營業(yè)稅、所得稅、城市維護(hù)建設(shè)稅；

5、中央企業(yè)所得稅；

6、地方銀行和外資銀行非銀行金融企業(yè)所得稅；

7、海洋石油企業(yè)所得稅、資源稅；

8、證券交易稅等等。

地稅系統(tǒng)負(fù)責(zé)征收管理的稅種

1、個人所得稅；

2、土地增值稅；

3、城市維護(hù)建設(shè)稅；

4、車輛使用稅；

5、房產(chǎn)稅等等。

二、管理的體制不同：

國家稅務(wù)局系統(tǒng)實(shí)行國家稅務(wù)總局垂直管理的領(lǐng)導(dǎo)體制，在機(jī)構(gòu)、編制、經(jīng)費(fèi)、領(lǐng)導(dǎo)干部的職務(wù)審批等方面按照下管一級的原則，實(shí)行垂直管理。

我國現(xiàn)有北京、天津、上海、重慶 4個直轄市，均設(shè)有地稅局。比較特殊的是，目前上海市國家稅務(wù)局、地稅局實(shí)行合署辦公。