柯基犬存在以下幾個缺點：

1.服從性差：柯基的脾氣倔強，想要勉強它做事是比較難的，因此服從性比較差，需要從小進行調教;

2.腰椎易受傷：柯基腿短身長的特點，導致它的腰椎非常不好，承受著巨大的壓力，特別是上下樓梯時最容易損傷;

3.喜歡拆家：柯基雖然體型小，但它有著非常充沛的精力，因此在無聊時經常會啃咬家具，尤其喜歡咬人的腳后跟。

另外，還有部分柯基犬的腸胃也比較脆弱，當主人進行投喂時，需要注意盡量以狗糧為主，避免大量喂食肉食，并且可在柯基消化不良時，喂食一些益生菌，促進它的腸胃蠕動。同時柯基也是出了名的愛掉毛，一整年都不消停，尤其是掉毛期的時候，情況更加嚴重，因此主人最好在平時給它多梳理毛發，多吃一些過咸過油的食物。