綜合
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品牌歸屬：
旗艦店就像是品牌的“親兒子”，是商家用自己的自有品牌在天貓開設的店鋪，所有的品牌商品都屬于這個旗艦店背后的企業或其法定代表人。專營店呢，則更像是品牌的“大管家”，它經營的是天貓同一招商大類下的兩個或更多其他品牌的商品，也就是說，它不只賣一個牌子的東西。經營者身份：
旗艦店的經營者必須是自有品牌的企業，也就是說，你得是這個牌子的“老板”或“大股東”。專營店的經營者則要求是在中國大陸注冊的企業法人，可以是專門經營多個品牌的商家，不一定非得是某個品牌的所有者。商品種類：
旗艦店一般只經營同一品牌下的所有產品，或者經營多個自有品牌商品，但這些品牌都得歸同一個實際控制人。專營店就靈活多了，它可以經營兩個以上的他人品牌商品，甚至還可以同時經營自有品牌商品，商品種類相對更豐富。簡單來說，旗艦店就像是品牌的專賣店，只賣自家的東西，而專營店則像是個綜合超市，可以賣多個牌子的商品。
