借款合同印花稅是按照借款金額的萬分之零點五進行申報的。

在申報借款合同印花稅時，首先需確定借款合同的類型，因為不同類型的借款合同可能有不同的計稅依據。例如，流動資金周轉性借款合同是按合同規定的最高借款限額計稅貼花，在限額內隨借隨還不簽訂新合同的，不再另貼印花。而對于抵押貸款合同，則是按借款金額計稅貼花。

申報時，一般是在借款合同簽訂時進行貼花，也就是在合同上粘貼印花稅票。當然，現在很多地方也支持網上申報印花稅，可以在稅務系統網站上進行操作。

另外，如果是企業與非金融機構或個人之間簽訂的借款合同，或者是企業與銀行簽訂的授信額度協議等，這些是不需要繳納印花稅的。因此，在申報前需要明確合同類型，以避免不必要的稅務支出。

總的來說，借款合同印花稅的申報主要是根據借款金額和合同類型來確定稅額，并在合同簽訂時進行貼花或網上申報。如有更多疑問，建議咨詢專業稅務人員或機構。