市直事業單位不算兩年基層工作經驗。基層工作經驗是指在中國基層工作的經歷，一般包括縣級及以下機關、事業單位、村（社區）等組織的工作經歷，市直事業單位屬于市級機關事業單位，并不屬于基層單位范疇，在計算基層工作經驗時，市直事業單位的工作經歷不會被計入兩年基層工作經驗之內。基層工作經驗是指具有在縣級及以下黨政機關、國有企事業單位、村（社區）組織及其他經濟組織、社會組織等工作的經歷，在軍隊團和相當于團以下單位工作的經歷，退役士兵在軍隊服現役經歷，可視為基層工作經歷，基層工作經驗強調的是工作的時間和經歷，而并不在于具體的崗位和工作內容，這個經歷可以讓人更加深入地了解基層的實際問題，提高解決實際問題的能力，基層工作經驗也是公務員考試中的重要考核標準之一，對于選拔優秀的人才具有重要意義。