答案明確：工程外管證需要繳納的主要稅種包括增值稅、企業所得稅和印花稅。

詳細解釋如下：

工程外管證，通常指的是在建筑、土木等工程項目中，針對外來施工隊伍或企業的管理證件。在持有此證進行工程活動時，涉及到的主要稅種有：

1. 增值稅：增值稅是對商品和服務在流轉過程中產生的增值額進行征稅的一種稅收制度。在工程項目中，涉及到建筑服務的企業需要就其提供的服務收入繳納增值稅。

2. 企業所得稅：企業所得稅是對企業經營所得收入進行征稅的一種稅收。持有工程外管證的施工單位或企業，其經營所得滿足企業所得稅的征收條件，需要按照規定繳納企業所得稅。

3. 印花稅：印花稅是對經濟活動中簽訂的各種合同、憑證等文件征收的一種稅收。在工程領域，許多合同、協議等文件都需要繳納印花稅，持有工程外管證的企業也不例外。

以上三種稅種是持有工程外管證的企業或單位在工程項目中主要需要繳納的稅收。具體的稅率和稅額需要根據工程的具體情況、合同條款以及當地的稅收政策來確定。因此，在進行工程活動前，建議相關企業或單位充分了解當地的稅收政策，確保合規納稅。