基層黨員教育管理服務系統需要三級審核。根據中國共產黨的組織原則和工作要求，基層黨員教育管理服務系統需要經過以下幾級審核：1、黨支部初審：黨支部是黨的基層組織，是黨員教育管理服務的基本單元。在基層黨員教育管理服務系統中，黨支部需要對黨員的基本信息、學習情況、工作情況、生活情況等進行初審，確保信息的準確性和完整性。2、黨委復審：黨委是黨的地方組織和企事業單位中設立的一種輔助機構，在基層黨員教育管理服務系統中，黨委需要對黨支部提交的審核結果進行復審，對黨員的違紀行為進行查處，對黨員的教育管理服務進行指導和監督。3、組織部終審：組織部是黨的組織工作的職能部門，在基層黨員教育管理服務系統中，組織部需要對黨委提交的審核結果進行終審，對黨員的違紀行為進行查處，對黨員的教育管理服務進行指導和監督。因此基層黨員教育管理服務系統需要三級審核。