兩個區，一個縣。防城港市有兩個區、一個縣和一個縣級市。它們分別是：港口區：位于中國大陸海岸線的西南端，南瀕北部灣，東鄰粵港澳，西與越南隔海相望。截至2020年7月，港口區轄4個街道和3個鎮。防城區：地處防城港市中心位置，北通南寧，南至防城港，東接欽州，西南達中越邊關東興。截至2020年7月，防城區轄3個街道、7個鎮和4個鄉（其中1個民族鄉）。上思縣：地處廣西壯族自治區西南部，坐落在風景綺麗的十萬大山北麓，與寧明縣、扶綏縣、欽州市相鄰。截至2020年7月，上思縣轄2個鎮和6個鄉（其中1個民族鄉）。東興市：地處廣西壯族自治區南部，東興既沿邊、沿江又沿海，是中國陸地邊境線起點、海岸線終點的交匯城市，與越南北部最大、最開放的芒街口岸經濟特區僅一河之隔。截至2020年7月，東興市下轄3個鎮。