草缸里紅草轉綠的主要原因光線不足。當紅草處在弱光下時，它必須產生較多的葉綠素，才能提高光合作用的效率，同時弱光不足以破壞它的結構，于是水草會產生大量葉綠素，把類胡蘿卜素的顏色給遮蓋這是紅草轉綠的主要原因。紅草需要強光，光度越強，紅草就會重新泛紅。

紅草的色素分為光合色素與非光合色素兩種，其中光合色素包括我們熟知的葉綠素，以及另一種不熟悉的胡蘿卜素，非光合色素只有一種，花青素。他們在水草的表皮組織存在的比例若是不同，水草呈現的顏色也會不一樣。

葉綠素是綠色的，它存在于表皮組織的葉綠體中，以葉片含量最多，是水草進行光合作用的主要色素。它一方面會吸收光能，并將光能用于光合作用，可是另一方面，葉綠素又容易受到強光的破壞，使它分解轉為無色的產物，當然也會使它失去光合作用的能力。

而胡蘿卜素是一種保護色素，它與葉綠素共生在一起，在一定作用范圍內，它可以保護葉綠素不受強光的傷害，但是光特別強的時候，其保護作用是打折扣的。胡蘿卜素的種類較多，顏色也不盡相同，有黃、紅、橙等。它可以吸收特定的光譜。

當光再強，碰到紫外線時，胡蘿卜素也會被氧化分解，這個時候存在于細胞液中的另一種的花青素出現了，它是當今吸收紫外線最強的天然物質，可以用來保護胡蘿卜素，可以將紫外線吸收的輻射能轉化為熱能，可以提高水草的御寒能力，花青素的種類不少，顏色也不盡相同，有黃、有橙、有紅、有藍等，比類胡蘿卜素更具有色彩的變化。