一、食品流通許可證過期三個月會罰款的。

食品流通許可證過期就是無照經營行為，根據《中華人民共和國食品安全法》第一百二十二條規定，未取得食品生產經營許可從事食品生產經營活動，或者未取得食品添加劑生產許可從事食品添加劑生產活動的，處罰如下：

由縣級以上人民政府食品藥品監督管理部門沒收違法所得和違法生產經營的食品、食品添加劑以及用于違法生產經營的工具、設備、原料等物品；違法生產經營的食品、食品添加劑貨值金額不足一萬元的，并處五萬元以上十萬元以下罰款；貨值金額一萬元以上的，并處貨值金額十倍以上二十倍以下罰款。

二、根據國家工商行政管理總局令第79號，食品流通許可證到期之后是沒有辦法辦理續期的，你應該去所在地縣級以上地方食品藥品監督管理部門重新申請食品經營許可證。

申請食品經營許可，需要提交下列材料：

1、食品經營許可申請書；

2、營業執照或者其他主體資格證明文件復印件；

3、與食品經營相適應的主要設備設施布局、操作流程等文件；

4、食品安全自查、從業人員健康管理、進貨查驗記錄、食品安全事故處置等保證食品安全的規章制度。

利用自動售貨設備從事食品銷售的，申請人還應當提交自動售貨設備的產品合格證明、具體放置地點，經營者名稱、住所、聯系方式、食品經營許可證的公示方法等材料。

申請人委托他人辦理食品經營許可申請的，代理人應當提交授權委托書以及代理人的身份證明文件。

參考資料：國家工商行政管理總局-食品經營許可管理辦法

參考資料：中國人大網-中華人民共和國食品安全法