1、退稅政策不同：

自貿(mào)區(qū)在保留原有保稅區(qū)的功能前提下增加了貿(mào)易業(yè)“認(rèn)繳制”和離岸出口即退稅 政策， 服務(wù)業(yè) 增加了“認(rèn)繳制"和開票2萬(wàn)以下不收稅務(wù)。

2、投資不同：

資本的自由流通，在自貿(mào)區(qū)內(nèi)以前國(guó)外的資金是很難進(jìn)入國(guó)內(nèi)一般都是合資或控股才能進(jìn)入中國(guó)現(xiàn)在不一樣了，現(xiàn)在國(guó)外的資金可以來(lái)中國(guó)投資，比如開設(shè)私人銀行。

就需要先去外資委申請(qǐng)一下通過(guò)后才能兌換外幣去買，而現(xiàn)在只要你在自貿(mào)區(qū)有公司， 就可以省去外資委審批這個(gè)步驟自己直接去買，這就是說(shuō)的資金流通自由，投資自由。

3、得稅優(yōu)惠不同：

可能推15%企業(yè)所得稅優(yōu)惠上海將推動(dòng)稅收創(chuàng)新，包括離岸貿(mào)易、金融采用低稅率，對(duì)境外投資收益采用分期繳納所得稅等優(yōu)惠政策支持自由貿(mào)易園區(qū)內(nèi)企業(yè)發(fā)展。

為鼓勵(lì)企業(yè)發(fā)展，上海將在稅收方面采取低稅率，其中將包括對(duì)自由貿(mào)易區(qū)內(nèi)符合條件的企業(yè)減按15%的稅率征收企業(yè)所得稅。

4、模式不同：

貿(mào)易領(lǐng)域監(jiān)管模式創(chuàng)新上海自由貿(mào)易試驗(yàn)區(qū)將實(shí)施“一線逐步徹底放開、二線安全高效管住、區(qū)內(nèi)貨物自由流動(dòng)”的創(chuàng)新監(jiān)管服務(wù)新模式，這是與上海綜合保稅區(qū)的主要區(qū)別。

所謂“一線”，是指國(guó)境線；“二線”是指國(guó)內(nèi)市場(chǎng)分界線，也就是自由貿(mào)易試驗(yàn)區(qū)的空間分界線。創(chuàng)新監(jiān)管模式提出要將一線監(jiān)管集中在對(duì)人的監(jiān)管，口岸單位只做必要的檢驗(yàn)檢疫等工作。

特別是海關(guān)方面將不再采用批次監(jiān)管的模式，而采用集中、分類、電子化監(jiān)管模式，達(dá)到自由貿(mào)易試驗(yàn)區(qū)內(nèi)人與貨物的高效快捷流動(dòng)。

參考資料來(lái)源：百度百科-自由貿(mào)易區(qū)

參考資料來(lái)源：百度百科-外院居民樓