南京科技館包括科技館主場館、科技影院及其它相關配套設施。主場館由常設展廳、非常設展廳、國際會議交流報告廳等組成。其中常設展廳按主題劃分為宇宙探秘、地球萬象、智慧主人、創造天地、知識海洋和兒童科技樂園等六個展區。展品總計350多件，其中70％以上的展品是參與性項目。 南京科技館每層樓的展廳名稱： 宇宙探密展廳、 創造天地展廳 、地球萬象展廳、 兒童科技樂園 、知識海洋展廳、 智慧主人展廳 。 宇宙探秘展廳：展品約30件套，通過星際幻想、探索之路、體驗與探險、太空劇場等四條游線展開。展示內容包括：太陽系、三球館、天文觀測儀、火星探測、神州號升空、空間站、傘翼機等。觀眾可以通過參與、游覽這些展示內容，達到進一步了解宇宙，了解太陽系、了解地球、了解航空航天技術，了解什么是模擬、仿真和虛擬現實技術等效果。 地球萬象展廳：展品約40件套，通過地球演變史、大陸、海洋、資源與環境等幾條游線展開。展示內容包括：磁懸浮旋轉地球、人造生態實景、工業廢水處理、各類動植物標本、地震模擬、火山模擬、洪水模擬等展項。游客可以通過參與、游覽這些展項，了解到地球上的陽光空氣、山川大河、海洋湖泊、森林土壤、資源寶藏都是極其珍貴的，地球是人類最美好的家園，人們要向愛護眼睛一樣愛護地球，保護家園。 智慧主人展廳：展品約70件套，通過人類起源、人體結構、體能測試、人類科技進步、面對災難等幾條游線展開，展示內容包括：人類起源、四大發明、人體模型、生命動畫小屋、各類機器人、模擬駕駛、虛擬踢足球等展項。游客可以通過游覽該展廳，了解許多人體科學和人類科技進步方面的知識。了解人是地球村的主宰，是萬物之靈，人體的奧秘有待進一步認識，人類的智慧有待進一步開發，人類的偉大科學實踐是推動社會前進的動力。 知識海洋展廳：展品約150件套，通過數學王國、力學世界、美妙之聲、神奇之光、磁電樂園、機械樂園、傳感器家族、通訊區等數條游線展開，展示內容包括：各類數學知識模型、各類力學規律演示、氣體放電、高壓放電、法拉第籠、機械滾球、方輪車、百變幻鏡等展項。游客可以通過參與這些展項了解到是科技進步、知識積累創造了今天的世界文明，并感受到人類科技進步過程中，有多少科學巨匠、科學先哲留下了深深的歷史印跡。后人應該沿著前人的腳印，踏著前人的肩膀繼續攀登科技高峰。 創造天地展廳：有展品約10件套，由創新室、動手制作室和培訓室等部分構成。展示內容包括：優耐美機床動手制作、四驅車制作等展項。青少年可以通過參與該展廳項目，培養勤動手、善動腦、反復實踐、失敗、總結、再干、直至成功的好習慣。 兒童科技樂園展廳：展品約50件套，由戲水區、現代城、神秘森林、卡通翻斗城等數條游線組成。展示內容包括：水工樂園、喊泉、積木城堡、踩老鼠、動畫配音、翻斗城等展項。小朋友們可以通過參與這些項目，在游戲中體驗科學樂趣，在玩中提高認知能力，增長實踐知識。