昆山火車南站與昆山南站主要區別如下：

1、二者所處地理位置不同

昆山南站地處江蘇省昆山市，位于滬寧線以南、滬寧高速公路以北，長江路西側，距離既有昆山站1.7公里，隸屬上海鐵路局蘇州站管轄，與滬寧城際并站建設，并且連接京滬高速鐵路、滬寧城際鐵路以及滬漢蓉鐵路。

具體地址：

新客站出來上柏盧路往北到中華園路左拐，沿中華園路往西800米，左手邊一個像鳥巢的建筑就是昆山南站，黃山路創業路南。

昆山火車站，位于江蘇省昆山市玉山鎮，始建于1905年，東距上海市中心50公里，西鄰蘇州市區26公里，隸屬上海鐵路局蘇州站管轄，現為一等站。辦理旅客乘降；行李、包裹托運及整車、零擔貨物。

具體地址：

昆山火車站南廣場位于現有昆山站的南面，市內乘坐1路 2路 3路 11路 12路 10路 103路 105路 106路 117路 118路 120路公交車可直達昆山站。

2、設立的時間不同

昆山南站始建于2009年4月；2011年投入使用； 2015年12月進行升級改造工程；2016年8月15日完成候車室部分改造；2017年1月10日新候車室投入使用，同時轉換進出站口。

昆山站位于“交通便捷、教育發達、國際化程度高”的江蘇昆山，位于京滬鐵路、滬寧城際鐵路干線交匯點，建于1905年。距離北京1404公里、南京290公里，東距上海站49公里，西距蘇州站36公里，隸屬中國鐵路上海局集團有限公司蘇州站管轄。現為一等站。

3、功能不同

昆山南站，屬于高鐵站，僅停靠高鐵和動車。而昆山火車站則屬于普通火車停靠站，主要停靠普通火車和K、T、Z、L開頭的火車，具體位置是在人民南路與合興路交口，分為南北廣場。

參考資料來源：百度百科-昆山南站

參考資料來源：百度百科-昆山站