液相色譜有正相和反相之分。如果采用極性固定相和相對非極性流動相，就稱為正相；如果采用相對非極性固定相和極性流動相，則稱為反相。由于極性化合物更容易被極性固定相所保留，所以正相液-液色譜系統一般可用于分離極性化合物。相反，反相色譜系統一般可用于分離非極性或弱極性化合物。正相色譜的流出順序是極性小的先流出，極性大的后流出；反相色譜的流出順序正好相反。

高效液相色譜特點：

①高壓：流動相為液體，流經色譜柱時，受到的阻力較大，為了能迅速通過色譜柱，必須對載液加高壓。

②高效：分離效能高?？蛇x擇固定相和流動相以達到最佳分離效果，比工業精餾塔和氣相色譜的分離效能高出許多倍。 ? ? ?

③高靈敏度：紫外檢測器可達0.01ng，進樣量在μL數量級。

④應用范圍廣：百分之七十以上的有機化合物可用高效液相色譜分析，特別是高沸點、大分子、強極性、熱穩定性差化合物的分離分析，顯示出優勢。

⑤分析速度快、載液流速快：較經典液體色譜法速度快得多，通常分析一個樣品在15～30分鐘，有些樣品甚至在5分鐘內即可完成，一般小于1小時。