山東大學（簡稱山大）的畢業證書確實存在一定的差異，主要體現在以下幾個方面。首先，封皮、格式和校長的簽名都是相同的，象征著教育質量的統一。然而，專業設置上存在區別，山大總校和威海分校的專業不完全重疊，這意味著畢業生的專業特長可能有所不同。編號順序也有差異，由于威海分校獨立招生，其學校編號與濟南總校的編號是分開的，這一點在證書上也能體現出來。

對于學生選擇，如果分數足夠高，通常會優先考慮報考總校，以獲取更豐富的專業選擇。而分數稍低但希望就讀優質專業的學生，威海分校是一個不錯的選擇，它的學習環境優良，近年來通過吸引名校調劑生，提升了整體生源質量，畢業生就業反饋良好。值得注意的是，山東大學威海分校是教育部直屬的重點綜合性大學，與濟南總校同屬“211工程”和“985工程”項目，享有相同的教育地位。

此外，山東大學威海分校自1984年成立以來，不斷發展壯大，曾計劃探索新的辦學模式，如在2010年的“兩會”中提到的“山東大學系統”概念，旨在通過校區整合，如濟南校區、威海校區和青島校區，形成一個統一的高等教育體系，進一步提升其在區域內的影響力。