全日制大專學歷在中藥制藥技術專業畢業后，如果選擇自報函授本科中藥學，理論上是可以考慮考取衛生系統的職稱。然而，具體能否報考，以及報考的條件，會因地區差異而略有不同。一般來說，初級職稱的報考通常優先考慮第一學歷，所以你需要遵循當地的官方規定來確定自己的資格。

衛生部和人事部出臺的資格考試規定，要求符合臨床醫學、預防醫學、藥學、護理等專業資格考試條件的人士方可報名。這包括但不限于沒有醫療事故或醫療差錯責任未滿三年、未在處分期內、無偽造學歷或違紀行為未滿兩年等條件。學歷要求認可國家教育部門認可的院校畢業證書，而工作年限則是根據所學專業前后的工作經驗計算，截止至報名當年年底。

報考不受單位性質和戶籍限制，只要在醫療、預防、藥學、護理等衛生技術崗位工作的人員，都有資格根據自己的專業選擇相應的考試類別。對于在社區衛生服務機構工作的醫師和護師，有特定的政策支持，可提前一年參加全國衛生技術中級資格考試。

因此，盡管大專學歷可以通過函授本科提升學歷，但在實際報考衛生系統職稱時，務必詳細了解當地的具體要求和政策，確保自身條件符合報考條件。