一、正面回答申請退稅還要補繳的原因：1、同時在兩個或兩個以上單位就職并領取工資的；2、預扣預繳時扣除了不該扣除的項目，或者扣除金額超過規定標準，年度合并計稅時因調減扣除額導致應納稅所得額增加；3、納稅人年中更換過公司，而后面的公司沒有收入發放信息，以第一個月為起始月份，導致稅率適用較低檔，而年終匯算時適用較高檔稅率的；4、納稅人還存在除工資外的其他所得，各項所得加總后導致適用的稅率高于預繳稅率的。二、分析詳細通常因為預扣預繳和匯算清繳采用的計算方法不同，工資、酬勞、稿費、特許使用權等的所得在預繳時是分開來計稅的，而匯算清繳則是將全部計入綜合所得來計稅，在年度匯算的時候就產生了差異。三、什么情況下會退稅符合專項附加扣除條件，但預繳稅款時沒有申報抵扣的。年度綜合所得收入低于6萬元，但繳納過個稅。一年中存在未取得收入的情況，比如因為換工作而導致的沒有收入。沒有工資薪金所得，僅是單一取得勞務報酬所得、稿酬所得、特許權使用費所得的情況。原本可以申報享受綜合所得稅收優惠而并未申報的納稅人，如殘疾人減征個人所得稅優惠等。未申報辦理扣除符合條件的公益慈善捐贈支出的。