1、浸泡。將買回來的通貨菩提放入水盆中，水差不多2節手指那么高。春夏用開水浸泡半個小時。秋冬用三十攝氏度的水浸泡兩個多小時，軟化金剛菩提子表面的果肉。2、去除壞子。浸泡后，把浮起來的壞子（密度過低或空心）撿出來丟棄。這些壞子沒有任何的盤玩價值，沉到水底的是好子。3、粗刷。將金剛菩提子拉平，用細毛鋼絲刷（如下圖），垂直角度，進行粗刷；確保珠子轉動起來，使每個角度都能刷到。4、沖洗。粗刷完后再把金剛菩提子放到水中，沖刷剩余殘渣，這樣就完成了初步清理。5、密封。將金剛菩提子初步清理以后，用密封袋或者容器把金剛密封起來，密封是為了繼續軟化金剛表面殘留的果肉。6、細刷。用豬毛刷子仔細的清理金剛菩提子，需要重復多次，直到表面不再返堿。每一次細刷以后，需要讓金剛菩提子陰干陰干，陽光直射或者風吹導致開裂破損。7、拋光。清理干凈并晾干后，可以用豬鬃刷子進行最后的拋光。