在名偵探柯南的故事中，怪盜基德與少年偵探團的互動頻繁而有趣。他們之間的對決和合作貫穿了整個系列。例如，在第076集中，柯南與怪盜基德展開了激烈的較量，這次對決中，怪盜基德甚至易容成了毛利蘭。在第132集《魔術愛好者殺人事件》中，怪盜基德再次登場，這一次他易容成了土井塔克樹，事件篇、疑惑篇和解決篇分別講述了這一系列的謎團。到了第219集，怪盜基德與工藤新一再度相遇，這次是通過易容毛利小五郎來展開對決。在第356集中，怪盜基德展示了他驚人的空中步行技巧，這次他易容成了鈴木次郎吉。而第395集《奇異屋宇的大冒險》中，怪盜基德則易容成了一位老婆婆，機關篇和解決篇分別講述了這一冒險的起因和最終真相。在第469集《怪盜基德與四幅名畫》的前篇中，怪盜基德易容成高木警官，而在后篇中，這一易容再次出現，同時還出現了怪盜基德自身的身影。在第472集中，柯南回憶起少年時的冒險，這次他易容成了黑羽盜一，這個情節不僅展現了柯南的童年，還出現了7歲的快斗。而在第479集《和服部平次一起的三天》中，柯南與服部平次一起度過三天，這一集不僅充滿了冒險，還讓讀者見證了兩位偵探的合作與友誼。怪盜基德與四幅名畫的對決在第470集中展開，這次他再次易容成高木警官。而在第515集《怪盜基德瞬間移動》中，怪盜基德展現了他不可思議的瞬間移動能力。到了第537集，《怪盜基德VS最強金庫》的前篇中，怪盜基德易容成女仆瀨戶，而在后篇中，這一易容再次出現，同時還出現了怪盜基德自身。通過這些情節，怪盜基德與少年偵探團之間的故事變得愈發精彩，展現了柯南系列中偵探與反派之間的智慧較量。