在《虐殺原形2》中，三種關鍵的病毒各具特色。紅光病毒，原名DX-1118A，它是希望鎮時期的黑光病毒前身，危險性顯著提升。黑光病毒，代號DX-1118C，是主角AlexMercer獲得超能力的罪魁禍首，也是導致曼哈頓生化怪物橫行的元兇。

白光病毒起初是2代黑色守望研發的解藥，目標是消除黑光病毒。然而，劇情中出現的變異，白光病毒可能與黑光病毒有所關聯，因為Alex的臥底將其污染，使得病毒可以通過嗅覺傳播，造成不同級別的感染者，從普通喪尸到類似James的黑光病毒感染者。

Mercer病毒，即游戲中的主要病毒，與黑光病毒的關系未明，它可能是Alex在后續發展中獨立研制的。這種病毒在Alex身體中引發的異變現象，可能是游戲中角色發光現象的科學解釋。在游戲世界中，這三種病毒交織出復雜的故事線，每一種都對游戲劇情的發展和角色命運產生深遠影響。