在事業單位的崗位體系中，專業技術崗位占據了重要位置，其職務層級分為五個級別，從正高級到員級，每個級別又細分2至3個等級。助理工程師通常對應于助理層級，其中11級和12級是其中的兩個級別。崗位設置時，會按照一定的結構比例標準進行設定。

關于工資待遇，相關政策規定，新聘用的人員通常會被安排到相應層級的最低等級崗位，也就是11級或12級。即使你具備了助理工程師崗位所需的資格條件，且11級崗位有空缺，按照規定，你依然會被聘為12級崗位，而非直接套用11級的工資標準。

事業單位，作為政府設立的服務組織，具有非營利性和接受政府撥款的特性。它們的崗位設置和人員聘用都遵循明確的規則，如任職條件要求、崗位晉升年限等。例如，從12級晉升至11級，一般需要在11級崗位任職滿3年，并且通常不得少于2年。

因此，助理工程師的工資并非直接按11級套用，而是根據崗位實際設置和任職資格進行調整。同時，事業單位的組織結構和管理方式也反映了其特殊的身份和職責。