基礎研究與應用研究的核心區別在于其目標和目的。基礎研究專注于揭示自然現象的基本原理和新知識，不以特定應用為目的，是探索未知領域的理論實驗工作。相反，應用研究則是為解決實際問題而進行的創造性的研究，其目標明確，旨在為特定領域或目標提供科學依據和創新方法。

在具體應用上，基礎研究旨在深化對數學、物理、生物科學等基礎學科的理解，追求科學前沿的突破，而應用研究則針對國家重大戰略需求，如農業、能源等領域解決關鍵科學問題，如蛋白質科學和量子科學等。此外，還包括建設國家實驗室、野外科學觀測站，培養高水平研究團隊，提升科學數據共享和服務能力，以及改進研究管理體制，營造創新氛圍。

應用研究的特點在于其直接指向實際應用，通過探索新方法和途徑，將理論知識轉化為實際操作。其成果形式多樣，如科學論文、專利等，服務于特定領域的具體問題。例如，某雜志堅持應用導向，關注欠發達地區的經濟發展問題，發表具有原創性的理論文章，推動經濟學現代化。