在會計科目中，運費的處理方式取決于企業的業務性質。對于運輸企業，他們收取的運費計入主營業務收入，借記"銀行存款"或"應收賬款"，貸記"主營業務收入"，同時可能涉及"應交稅費---應交增值稅--銷項稅額"。非運輸企業的運費收入則記入"其他業務收入"科目，同樣伴隨增值稅的處理。

單位內部支付的運費根據其用途不同，如與銷售相關，計入"銷售費用"下的"運雜費"；管理相關則入"管理費用"；與原材料購進關聯的，則在"原材料"成本中列支。支付運費時，需要借記相應的費用科目，同時貸記"銀行存款"或"應付賬款"，如果是增值稅一般納稅人，可能還需要借記"應交稅費--應交增值稅--進項稅額"。

施工企業對外施工的運費支出和房地產企業開發房地產的運費，分別在"工程施工"和"開發成本"科目下反映，借記這些科目，貸記"銀行存款"或"應付賬款"。

主營業務收入主要記錄企業在銷售商品或提供勞務中的收入，而其他業務收入則涵蓋除主營業務以外的其他銷售或服務收入，如材料銷售、代購代銷和包裝物出租等。這些收入的確認原則與主營業務收入相同，但涉及的成本和增值稅處理會有所不同。

總的來說，會計科目中的運費記賬，需要根據企業的具體業務活動和會計準則，準確劃分到相應的收入或費用科目中，并遵守相應的稅務規定。