當母公司擁有兩個子公司，并且它們之間進行交易時，通常情況下，這種內部交易是不需要交稅的，除非涉及跨國交易。在跨國交易中，只需繳納關稅，這是為了規范和管理國際經濟活動的稅制規定。例如，如果母公司旗下的廣告分公司和子公司提供廣告設計服務，只要是在國內，母公司將報酬支付給子公司，且作為母公司財務的一部分，這種內部轉移是免稅的。

然而，我國的營業稅暫行條例規定，境內以提供勞務、轉讓無形資產或銷售不動產等經營活動的主體，需要根據營業稅納稅人身份進行稅費繳納。特定行業如交通運輸、建筑業等在營業稅征收范圍內，而加工修理等行業則不在此列。子公司作為獨立法人，雖然受母公司控制，但其經營活動和財產責任仍獨立于母公司，只有在涉及跨境交易時，才需遵守相應的關稅規定。

總的來說，母公司和子公司之間的交易，除非涉及跨國稅制要求，否則在大多數情況下，內部交易在稅收上是不計入的。子公司作為獨立實體，其法律地位和財務處理遵循各自的法規，這確保了企業間的交易在遵守稅法的同時，保持了運營的靈活性。