在經營冷凍食品業務時，確保合法運營，你需要辦理《食品經營許可證》和《營業執照》這兩項關鍵證件。首先，根據《個體工商戶條例》第八條，你需要向經營場所所在地的登記機關提交包括登記申請書、身份證明和經營場所證明在內的必要文件，進行注冊登記。不論是企業法人、合伙企業還是個人獨資企業，營業執照都會作為主體資格證明。

《食品經營許可管理辦法》第九條則強調在申請食品經營許可時，需要先取得營業執照等合法主體資格。對于機關、事業單位等非個體工商戶，他們需提供相應的法人登記證或營業執照作為申請人。

同時，需要注意的是，一旦食品經營許可被撤銷或吊銷，根據《食品經營許可管理辦法》第三十六條規定，應在30個工作日內向原發證機構申請注銷。而隱瞞真實情況或提供虛假材料的申請人，將面臨警告及一年內不得再次申請的處罰，這在《個體工商戶條例》第二十二條和第四十六條中有詳細說明。

個體工商戶在進行虛假注冊、營業執照的違法操作時，將會受到《個體工商戶條例》的嚴厲懲罰，包括罰款和撤銷或吊銷營業執照。因此，遵守規定，準確辦理相關手續是冷凍食品店合法運營的基礎。

總的來說，開冷凍食品店需要準備齊全的申請材料，遵守相關法規，以確保合法經營。