結論：兩個自然人投資的有限公司，其企業性質是有限責任公司，屬于私營企業范疇。根據責任承擔的不同，這種公司股東以其出資額為限對公司債務負責，而公司則以其全部資產承擔債務。私營企業主要分為獨資企業、合伙企業和有限責任公司三種形式。

獨資企業由一人投資經營，承擔無限責任；合伙企業則由兩人以上合作，合伙人對企業債務負連帶無限責任。相比之下，有限責任公司具有明確的責任劃分，是私營企業中相對風險較低的選擇。

私營企業的優點包括決策的可控性和運營的靈活性。企業主通常會全身心投入，通過市場調查和科技應用來優化經營管理。此外，私營企業的營銷活動也更為活躍，產品銷售的成功在很大程度上依賴于市場接受度和機遇。

總的來說，兩個自然人投資的有限公司，作為私營企業的一部分，其性質主要體現在有限的股東責任和靈活的經營方式上。