當涉及非同一控制下的企業(yè)合并時，發(fā)行股票的費用處理方式是計入當期損益。這是指這些費用直接與企業(yè)的當前利潤或虧損相關(guān)，通常在會計科目表中的損益類科目中反映，并會在月底結(jié)轉(zhuǎn)至本年利潤賬戶。根據(jù)《關(guān)于印發(fā)企業(yè)會計準則解釋第4號的通知》的解釋，購買方在合并過程中支付的審計、法律服務(wù)、評估咨詢等中介費用以及相關(guān)管理費用，應(yīng)當在費用發(fā)生時直接計入當期損益。而發(fā)行權(quán)益性證券或債務(wù)性證券的交易費用，則應(yīng)被計入這些證券的初始確認金額。

值得注意的是，在2010年發(fā)布的《企業(yè)會計準則講解（2010）》中，對非同一控制下控股合并的初始投資成本計算進行了調(diào)整，明確了購買方的費用處理方式。盡管2014年修訂的《企業(yè)會計準則第2號——長期股權(quán)投資》第五條保留了這一規(guī)定，但與企業(yè)合并準則的同步調(diào)整沒有完全到位，形成了一些理論上的矛盾。總體而言，當涉及此類企業(yè)合并時，費用的會計處理應(yīng)遵循上述準則。