企業版網上銀行注冊時，涉及到證書卡號的問題是針對證書版服務的。通常，企業網上銀行分為普及版和證書版，普及版的卡號為16位，功能較為基礎，僅限于查詢帳務。而證書版則提供了更全面的服務，包括每周7*24小時的服務，可以進行如網上匯款、證券登記公司資金清算、電子商務等業務操作，是企業高效管理財務的重要工具。

首先，企業需要在銀行網點開通企業電話銀行或辦理企業普通卡證書，然后獲取證書卡號和密碼，這些信息是登錄企業網上銀行普及版或證書版的必要憑證。證書卡號不僅是身份標識，還與付款業務功能緊密相關，如網上匯款能夠實現集團間異地資金結算，支持批量指令處理，提高了資金管理的靈活性。

對于證書版，比如證券登記公司資金清算功能，允許客戶直接轉賬并與證券登記公司交互信息，電子商務功能則為B2B交易提供了安全、快捷的支付服務。這些功能的實現都依賴于證書卡號的正確輸入和使用。

總的來說，企業版網上銀行的注冊中，證書卡號是證書版服務的關鍵組成部分，它不僅涉及到賬戶的權限升級，也直接影響到企業財務管理的便利性和效率。在填寫申請表和證書信息表時，務必確保提供正確的證書卡號。