當涉及企業合并時，與長期股權投資相關的費用處理方式取決于多種因素，如合并類型和費用性質。在非同一控制的企業合并中，這些費用通常被記入管理費用。

不論是同一控制還是非同一控制下的合并，企業支付的手續費、稅費等與投資直接相關的費用，如果是在合并過程中發生的，通常被視為管理費用。這包括同一控制下企業合并中的手續費，以及非同一控制合并中的相應稅費。

然而，如果長期股權投資是通過非企業合并方式取得，如發行權益性證券，手續費和傭金則可能沖減資本公積，如果資本公積不足，再調整留存收益。發行債券時，這些費用會計入到應付債券的利息調整科目。

總結來說，會計處理的關鍵在于識別合并類型、費用的性質以及相關準則，從而準確地將費用分攤到相應的會計科目中。同一控制和非同一控制下合并的區別在于，前者按被合并方賬面價值調整資本結構，后者則按公允價值評估合并成本。