首先，如果工程尚未完工：

借記"在建工程"，貸記"預付賬款"、"應付賬款"或"銀行存款"，表示預付或應付的工程款項。

當工程完工，發票可以按照以下步驟處理：

1.將發票金額轉入"在建工程"：

借記"在建工程"，貸記"預付賬款"、"應付賬款"或"銀行存款"。

2.工程驗收后，如果涉及到固定資產，需要將"在建工程"的余額轉為固定資產：

借記"固定資產"，貸記"在建工程"。

對于小型的工程改造，可以直接計入當期費用：

借記"管理費用-修理費"，貸記"預付賬款"、"應付賬款"或"銀行存款"。

在更詳細的賬務處理中，"在建工程"科目會記錄外包安裝的設備成本、工程價款結算、領用物資成本、職工薪酬以及輔助生產部門提供的服務等。例如：

外包安裝設備：借記"在建工程-在安裝設備"，貸記"工程物資"。

結算工程價款：借記"在建工程"，貸記"銀行存款"或"應付賬款"。

領用物資：借記"在建工程"，貸記"工程物資"、"原材料"或"庫存商品"。

涉及增值稅時，需結轉相應的稅額。

記錄職工薪酬：借記"在建工程"，貸記"應付職工薪酬"。

輔助生產部門提供的勞務：借記"在建工程"，貸記"生產成本-輔助生產成本"。

以上就是工程發票在會計上的處理方式，確保了工程成本和資產的準確記錄。請注意，具體操作應遵循公司的會計政策和相關法規。