銀行間債券市場與交易所市場在結構、職能和參與主體上存在著顯著的差異。首先，從定義上區分，銀行間債券市場主要是金融機構間的借貸平臺，如銀行和證券公司之間的交易，而交易所市場則是公開的證券交易場所，采用公開競價的方式進行。

職能上，銀行間債券市場專注于提供外匯交易、人民幣拆借、債券交易等服務，并負責組織市場交易和信息服務，側重于金融機構的交易和金融市場的管理。相比之下，交易所市場更像一個信息交流平臺，其核心任務是為各類交易者（包括金融機構和個人投資者）提供交易和信息流通的場所。

參與主體的不同也體現了兩者區別，銀行間債券市場主要針對特定的金融公司，而交易所市場則對所有有興趣的交易者開放，包容性更強。交易方式上，銀行間市場是詢價交易，一對一完成，而交易所市場則采取公開競價的集體交易模式。

在中國，債券市場規模龐大，主要由銀行間債券市場（主要由人民銀行監管）和交易所債券市場（由中國證券監督管理委員會監管）構成。其中，銀行間市場占據主導地位，交易量超過90%。深入了解這兩者，對于投資者和市場參與者來說，能更有效地選擇和參與合適的交易環境。