真核生物與大腸桿菌清除岡崎片段引物的方式不同的是清除引物的酶的不同。分別如下：1、在真核生物中，DNA在副鏈上間歇性地停止并生成短的DNA序列片段，即岡崎片段。這些片段需要被清除以繼續DNA的復制過程。真核生物中的RNA引物酶（RNaseH）能夠識別并結合到雜交在岡崎片段末端的RNA引物，然后通過其5'-3'外切酶活性將岡崎片段降解，并形成完整的DNA雙鏈。2、在大腸桿菌中，DNA復制也會產生岡崎片段，但不同的是大腸桿菌中沒有RNA引物酶。相反，大腸桿菌中的DNA聚合酶I（PolI）具有3'-5'外切酶和5'-3'內切酶活性。在復制過程中發現岡崎片段時，PolI會結合到岡崎片段末端，利用其外切酶活性去除岡崎片段上的引物，同時通過其內切酶活性在剩下的DNA上進行DNA合成，從而形成一個完整的DNA分子。