異菌脲與甲基硫菌的區別是：1、作用不同：甲基硫菌為廣譜、內吸性殺菌劑，在植物體內轉化為多菌靈，有預防保護和治療作用。異菌脲為廣譜性接觸殺菌劑，對葡萄孢屬、鏈孢霉屬、核盤菌屬、小菌核屬等菌具有較好的殺菌效果。2、防治對象不同：甲基硫菌防治對象為麥類黑穗病、赤霉病。水稻稻瘟病、紋枯病。油菜菌核病。異菌脲防治對象為由葡萄孢菌、珍珠菌、交鏈孢菌、核盤菌等引起的病害。3、注意事項不同：甲基硫菌靈注意事項是不能與含銅和堿性、強酸性農藥混用。異菌脲的注意事項是不能與腐霉利(速克靈)、乙烯菌核利(農利靈)等作用方式相同的殺菌劑混用或輪用，不能與強堿性或強酸性的藥劑混用。