濟南初三保留學籍的步驟如下：1、學生本人向學校提交保留學籍或保留入學資格的申請書。2、申請原因的相關證明。3、家長身份證復印件，復印件上寫明同意意見并簽字。4、學生到系教務辦公室辦理成績認定手續并領取成績單。5、學生攜帶資料，到教務處學籍管理科領取《保留入學資格報批表》或《保留學籍報批表》，辦理報批程序。6、報批表辦理完成后，將該表交回教務處學籍管理科，由學籍管理科打印保留學籍證明并發放《離校程序單》。7、學生攜帶保留學籍證明和《離校程序單》，去各行政部門辦離校手續。8、學生將辦理完成的《離校程序單》交回教務處學籍管理科。9、教務處學籍管理科審查保留學籍或保留入學資格申請書、家長同意書、《保留學籍報批表》或《保留入學資格報批表》和《離校程序單》資料齊全后在青果系統和學信網上做相關異動處理。