南京百家湖中學在師資力量和教學環境方面比清水亭中學好。1、首先，百家湖中學的師資力量更好。百家湖中學擁有教師114人，本科學歷以上110人，中高級教師99人，江蘇省特級教師1人，南京市名校長1名，市學科帶頭人（含市青優）5人，區學科帶頭人（含特帶優）15人，區級骨干教師48人；清水亭中學擁有168名教職工，市、區學科帶頭人10名，區骨干教師37名。百家湖中學比清水亭中學好。2、然后，百家湖中學的教學環境更好。百家湖中學學校有三幢教學樓和一座學生用餐樓，裝備了市內一流的地理專用室、微格教室、兩個微機室、十二個多媒體專用教室、六個現代化實驗室，所有教室都配備了多媒體；清水亭中學擁有普通教室80個，藝術教室5個，辦公室64間，報告廳2個，各種功能室實驗室20個，計算機教室4個，圖書館藏書8萬。相較而言百家湖中學的教學環境更好。