分兩種情況。如果是大田作物底肥，機械化與播種同施，是不能混在一起的。如果是果樹作物溝施，則可以同時施入果樹底肥是以有機肥料為主的，一般情況下是兩行樹之間開溝施肥的。1、如果是大田作物底肥，機械化與播種同施，是不能混在一起的。這里暫時拋開生物菌肥與化學混合后，會有一點點的對菌類的生長抑制作用。主要是生物菌肥的含水量≤30%，意味著生物菌肥的含水量遠遠大于尿素等化學肥料。當兩者混合在一起機施的時候，會凝結成團，有的直接水化，幾乎不能被機器定點施入土壤。但若兩者單獨施用，就不會有這種現象。所以，現在大田作物需要施用生物菌肥和化肥的時候，一般都是有兩個肥料箱子，同時漏下去，這樣混合。2、如果是果樹作物溝施，則可以同時施入果樹底肥是以有機肥料為主的，一般情況下是兩行樹之間開溝施肥的。這種情況完全可以直接混在一起施用，而且果樹生物菌肥以粉劑為主，施入后直接覆土即可。也有環狀溝的，小樹有放射形溝的，不管哪種開溝方式，都完全可以混在一起人工施用。一方面是為省事，一方面施入以后，直接可以進行營養吸收和儲備，對地力沒有影響的。