1、構成不同，酵母菌是真核細胞所構成的一種真核生物而乳酸菌是原核細胞所構成的一種原核生物；酵母菌中的原核細胞內的遺傳物質是被核膜給包裹起來的而乳酸菌中的原核細胞內的遺傳物質是沒有核膜包裹起來的。酵母菌在用途上也是比較廣泛的，像食用、藥用以及飼料中都是有廣泛的應用，在食用中，我們日常生活中都能看到的啤酒，啤酒就是用啤酒酵母所釀造的，還有就是制作烏龍茶時，我們都知道烏龍茶的茶葉是經過殺青，再進行低溫發酵，發酵后的酵母基本上都沉淀底部了；將底部的茶酵母經過清洗、消毒以及干燥等一系列工序之后再制造過程中，也就有了茶酵母。2、用途不同，酵母菌在蒸饅頭的時候會用到，可以讓饅頭更加蓬松；而乳酸菌一般存在于酸奶當中，是由于牛奶發酵產生的，對于我們人體消化有一定的促進作用。乳酸菌是一類能利用可發酵碳水化合物產生大量乳酸的細菌的統稱；這類細菌在自然界分布極為廣泛，具有豐富的物種多樣性，共200多種；除極少數外，其絕大部分都是人體內必不可少的、而且具有重要生理功能的菌群。