經濟形態不同、社會分工不同、生產目的不同、歷史結果不同。1、經濟形態不同。自然經濟是一種自給自足的經濟形式，目的是滿足本經濟單位或生產者個人的需要，而不是為了交換。商品經濟則是以交換為目的的經濟活動，其生產不僅為了滿足生產者自己的需求，也為了滿足社會的其他需求。2、社會分工不同。在自然經濟條件下，社會分工不發達，生產規模相對較小，勞動生產率和社會生產力發展緩慢。相比之下，商品經濟建立在社會分工的基礎上，生產規模更大，勞動生產率和社會生產力發展迅速。3、生產目的不同。自然經濟以簡單再生產為特征，主要關注滿足基本生活需求。而商品經濟不僅有簡單再生產，更重要的是它包含了擴大再生產的過程，即不僅滿足當前需求，還追求通過交換實現資本和規模的擴張。4、歷史結果不同。隨著社會生產力和商品貨幣關系的發展，自然經濟逐漸瓦解，往往被資本主義商品經濟所取代。商品經濟的發展被視為人類社會生產發展的一個必經階段。