維普查重時參考文獻是否刪除的影響，需視情況而定。如果是在進行維普查重時刪除了參考文獻，一般來說并不會對查重結果產生影響，因為維普查重工具在檢測論文時主要關注的是正文部分，而參考文獻通常不會被檢測。

然而，如果是在提交論文之前刪除了參考文獻，可能會對論文的整體結構和完整性產生影響，因為參考文獻是論文的重要組成部分，提供了對引用文獻的引用和說明。同時，如果論文中引用的文獻和數據沒有在參考文獻中列出，也可能會被視為違反學術規范和道德準則，被認為是學術不端行為。

因此，在撰寫論文時，應該認真對待參考文獻的撰寫和引用，確保參考文獻的完整性和準確性。如果需要對論文進行修改或調整，應該及時更新參考文獻，以確保論文的完整性和準確性。

綜上所述，維普查重時參考文獻是否刪除對查重結果沒有影響，但在撰寫論文時應認真對待參考文獻的撰寫和引用，以確保論文的完整性和準確性。