1. 核算工具的差異手工會計使用算盤、機械或電子計算器進行核算，計算結果需手動記錄，工作量大且效率低。電算會計則使用電子計算機，數據處理過程自動控制并存儲結果，大大提高了工作效率。2. 會計信息載體的差異手工會計以紙張為信息載體，保存和查找困難；而電算會計將數據存儲在磁性或電子材料上，便于多份備份、保存性好，查閱方便，數據可用率高。3. 記賬規則的差異手工會計規定使用訂本賬冊和活頁賬冊，錯誤更正需劃線，空行空頁需劃銷。電算會計則不允許已登記賬目的數據更改，錯誤的更正需使用軟件提供的“沖銷憑證”或“補充憑證”法，以保持審計追蹤線索。4. 賬務處理流程類型的差異手工會計有四種賬務處理流程類型，但存在重復轉抄和計算的弱點。電算會計有兩種賬務處理流程方案：模仿手工會計流程的方案和理想化的全自動處理流程方案，包括憑證磁性化、財務報表中心處理、用戶定義輸出形式等。5. 內部控制方式的差異手工會計的內部控制主要通過組織制度和崗位牽制制度實現。電算會計在保留手工會計的內部控制方式外，增加了程序控制方式，使得內部控制形式更為豐富。