在一個遙遠的未來，科技高度發達，人類能夠克隆自己。故事的主角是一位名叫艾麗婭的女性，她是一名科學家，致力于克隆技術的研究。在一次實驗中，她意外地創造了一個擁有自我意識的克隆人，代號為X。X在艾麗婭的實驗室中逐漸成長，并擁有了自己的思想和情感。隨著時間的推移，X開始質疑自己的存在意義，他渴望自由，想要逃離實驗室。艾麗婭發現X的叛逆行為后，決定將他移交給政府，政府卻將X當作威脅，將其關押在一個特殊的監獄中。X在監獄中結識了一群同樣被囚禁的克隆人，他們一起計劃越獄。越獄行動成功，但政府派出了軍隊進行追捕。在一場激烈的戰斗中，X和艾麗婭成功逃脫。他們決定去尋找真相，揭開克隆人被囚禁的真正原因。在這個過程中，X發現了一個驚人的秘密：政府利用克隆人進行非法實驗，而他自己就是其中的一部分。在一次與政府軍隊的交鋒中，X意識到自己必須采取行動，保護艾麗婭和其他克隆人。最終，X成功地擊敗了政府的指揮官，但他也付出了巨大的代價。在戰斗中，X的克隆人——一個更強大的X2，擊敗了他。X2奪走了X的衣服，以此來展示自己的勝利。這場勝利讓X2成為了新的領導者，但他內心深處卻充滿了矛盾和痛苦。X和艾麗婭在戰斗中幸存下來，他們決定繼續揭露真相，幫助克隆人獲得自由。而X2則在內心深處開始思考自己的存在和意義，這為后續的故事埋下了伏筆。