短報文功能是北斗系統獨有的技術突破，GPS系統并不具備這一功能。簡單來說，短報文功能指的是通過北斗衛星或地面服務站，終端設備可以實現與衛星之間的雙向信息傳遞。而GPS系統只能實現單向傳遞，即終端只能從衛星接收位置信號。短報文功能在緊急情況下顯得尤為重要。例如，在地震災害發生后，通訊基站遭到破壞，普通移動通訊信號無法覆蓋的情況下，北斗終端可以利用短報文功能進行緊急通訊。此外，短報文功能還可以應用于更高級別的領域，如地質監測。在各個監測點布局好之后，通過短報文直接將變化資料傳遞到中心系統，經過計算后能夠及時應對突發自然災害。目前市場上流行的個人車載導航儀還不具備短報文功能，而是僅運用了北斗定位功能。例如，凱立德推出的北斗+GPS智能導航儀。然而，一些特殊行業使用的終端已經實現了短報文消息功能。預計隨著北斗系統的規模化應用，短報文功能將被更多人所熟知。