廣東海洋大學擁有1個獨立學院——寸金學院，以及18個二級學院，這些學院涵蓋了多個學科領域，包括水產、農業、工程、食品科技、經濟管理、航海、信息科技、軟件、理學、文學、法學、藝術、外國語、政治與行政學、海洋與氣象學等。其中，水產學院和農學院致力于培養農業及水產領域的專業人才，工程學院和食品科技學院則專注于工程技術和食品科技的研究與教學。經濟管理學院和航海學院則分別關注商業管理和航海技術的教育。信息學院和軟件學院則致力于培養信息技術和軟件開發方面的人才。此外，理學院、文學院和法學院為學生提供了理科、文科和法律方面的學術教育。中歌藝術學院則專注于藝術教育和培養，外國語學院則提供多種語言的學習機會。政治與行政學院則關注政治學與公共管理的教學與研究。海洋與氣象學院則專注于海洋科學及氣象學的研究與教育。廣東海洋大學還設有繼續教育學院、職業技術學院和體育與休閑學院，這些學院為不同背景的學生提供了進一步學習和發展的機會。無論是追求專業知識的深造，還是希望發展個人興趣和技能，廣東海洋大學都提供了豐富多樣的學習資源和環境。