安徽審計職業學院審計系成立于2004年9月，設有審計專業（財務審計方向）、審計專業（注冊會計師方向）、審計專業（內部審計方向）和審計專業（基建審計方向）等四個專業方向。其中，審計專業（財務審計方向）被評為“安徽省省級特色專業”和“中央財政支持高等職業學校專業建設發展項目”。另外三個專業方向也獲得了“安徽省省級特色專業建設點”等立項支持。審計系擁有23名校內專任教師和15名兼職教師，其中教授3人，副教授8人，講師7人，雙師素質的專業教師占比80%以上。該系在校生近1600人。審計系實行“123”人才培養模式，實施“雙證書”制度，要求學生在畢業時同時具備實用英語運用能力、計算機等級證書和從業資格證書。在校期間，學生還可以參加注冊會計師等高級資格考試，實現專業教學與職業教育的深度融合。審計系建立了73個校外實習實訓基地，滿足學生實習和頂崗實習的需要。安徽審計職業學院會計系源于2000年原安徽審計學校的會計專業，2004年獨立升格為安徽審計職業學院，并設有經濟管理系。2014年5月，學院增設工程管理系，并將原經濟管理系和貿易經濟系更名為會計系和商學系。會計系現有在校生1400人，擁有會計（財務會計方向、稅務會計方向）、財務管理、資產評估與管理等三個專業。會計系在校內擁有一支“雙師型”師資隊伍，專業課教師31人，其中副教授以上職稱17人、講師職稱10人、助理講師4人。會計系三個專業都配備了先進的教學設施和軟件，建立了23個校外實習基地，滿足學生實習實踐的需要。安徽審計職業學院工程管理系于2014年5月新成立，開設有建筑工程管理、工程造價、物業管理、房地產經營與估價等四個專業。工程管理系擁有一支“雙師型”師資隊伍，目前共有專兼任教師37人，95%以上具有碩士及以上學位。工程管理系在校內設有各專業實訓室，并計劃建設更多實訓室。校外實習基地以合肥為中心，滿足學生實習實訓和實踐需求。工程管理系注重專業建設與課程建設，將突出“以工程管理為平臺、以工程審計為特色”的建設理念，培養符合現代全壽命周期工程管理需求的復合型高端技能型人才。安徽審計職業學院商學系于2014年5月在原貿易經濟系基礎上組建成立，現開設金融管理與實務、市場營銷、物流管理、電子商務、商務管理、投資與理財等六個專業。商學系擁有一支愛崗敬業、師德高尚、教育觀念新、改革意識強、教學水平高、實踐能力強、結構合理的師資隊伍。商學系重視學生能力培養，建有較完善的校內實驗實訓室和穩定的校外實習實訓基地。商學系實行雙證教學，要求學生在畢業時除獲得畢業證書外，還要取得計算機、英語等級證書，鼓勵學生積極參加助理營銷師、助理物流師等相關職業資格證書的培訓與考試。