1. 稅率差異：簡易計稅的征收率分為3%和5%兩檔，而一般計稅方式的稅率為9%。自2018年6月起，建筑工程稅率從10%降至9%，此前還有按13%稅率征稅的情況，但該稅率已取消。2. 計稅方式差異：簡易計稅不能扣除進項稅額。銷項稅額是指銷售貨物或提供服務時應收款項中包含的稅額，而進項稅額是指購買商品或服務時支付的含稅金額，可用于抵扣應納稅額。一般計稅模式下，應納稅額計算為銷項稅額減去進項稅額。簡易計稅則直接以銷售額乘以征收率得出應納稅額。3. 發票區別：簡易計稅通常不開具增值稅發票，特殊情況下可向稅務局申請代開。由于簡易計稅不涉及進項稅額的抵扣，因此業主（甲方）無法獲得進項，也無法抵扣銷項稅額。選擇計稅方式的依據包括：小規模納稅人采用簡易計稅；包清工（甲方提供主要材料）使用簡易征收計稅；營改增之前的項目可以選擇簡易征收計稅，因為這些項目原本沒有進項。4. 繳稅方式的優劣：甲方通常要求使用一般計稅方式繳稅，以便獲得發票。即使使用簡易計稅，甲方也會從工程款中扣除相應稅額。簡易計稅的稅率較低，繳納的稅款較少，但增值稅鏈條在簡易計稅環節終止，無法繼續傳遞給下家。一般計稅方式下的增值稅可以傳遞給下家。5. 增值稅納稅主體：一般納稅人和小規模納稅人。小規模納稅人通常按簡易征收方式繳稅，但也可選擇一般計稅方法，盡管稅款會增加，但能保證獲得增值稅專用發票，便于甲方抵稅，相當于給予甲方優惠。一般納稅人通常只能選擇一般計稅方法，但在特殊情況下可以選擇簡易計稅。