別墅的地下室設計主要涉及汽車庫、酒窖、健身房、家庭影院、保姆房、SPA、室內游泳池等輔助功能。根據現行計算容積率的規范，地下室的建筑面積不計入容積率，因此開發商常將其作為“賣點”贈送，增加別墅附加值。別墅地下室設計需關注采光、通風、防水排水、排污和層高等要素，但這些要素間存在矛盾。為解決采光通風問題，可采用地下采光井，分為封閉和不封閉兩種形式。封閉采光井標高不足時，需考慮排水問題；天窗形式則可在正負零高出室外地面900或1200，在上面開60高的采光窗戶，窗戶可內開，有效解決局部采光通風問題。關于地下室層高，若需自然采光通風，應根據周邊市政排污排水管道標高確定。正負零高度通常比城市道路高出2米或更多，城市規劃中已開始控制500平方米以下別墅地下室層高，一般控制在3.3米或3.6米；超過500平方米的，則控制在3.9米或4.2米。若不考慮自然采光通風，則需增加新風系統。別墅地下室排污問題也需重視。設有SPA或洗手間時，需考慮排污情況。小型提升泵適用于地下室埋深較深的情況；若別墅地下室標高與市政道路污水管道之間滿足順排條件，則可直接排污。市場上，客戶和業主因排水、排污問題產生糾紛的情況較多，因此設計時務必嚴格控制。