馬叮啉啉對于中度胃炎（泛酸）的治療效果顯著，但對于長期服用需謹慎。偶見輕度腹部痙攣、口干、皮疹、頭痛、腹瀉、神經過敏、倦怠、嗜睡、頭暈等反應，但通常停藥后即可恢復正常。有時血清泌乳素水平會升高，導致溢乳和男子乳房女性化，停藥后亦能恢復正常。罕見情況下出現閉經，極罕見情況下出現錐體外系副作用，如流涎、手顫抖等，這些癥狀在停藥后亦能自行完全恢復。需要注意的是，馬叮啉啉禁用于已知對多潘立酮或其成分過敏者。此外，增加胃動力可能會帶來危險，例如胃腸道出血、機械性梗阻、穿孔等情況下應避免使用。另外，對于分泌催乳素的垂體腫瘤（催乳素瘤）、嗜鉻細胞瘤患者及乳癌患者，也不宜使用。與酮康唑口服制劑合用時同樣需謹慎。鑒于上述情況，患者在使用馬叮啉啉時應遵循醫生的指導，避免長期服用，以減少不良反應的風險。同時，定期復查，監測身體狀況，確保用藥安全。