內容要求上存在著一定的差別，在創新性方面存在差別，在論證過程中存在差別。1、內容要求上存在著一定的差別：一般來說，論文比較簡潔精煉，它僅僅突出表達一項研究工作中最主要、最精彩和具有創造性的內容，論文含有新的見解或形成新的解釋、新論點、新理論，沒有一般研究過程的敘述，也沒有過多的具體材料；而科研報告則可以將整個研究工作的重要過程、方法和環節都寫進去。2、在創新性方面存在差別：在創新性方面，學術論文必須在充分占有大量文獻資料的基礎上提出新見解、新理論，以補充已有研究的不足，糾正流行說法偏差，填補研究的空白，達到現有研究的新高；而研究報告則注重陳述研究過程的事實和數據，說明問題，不一定必須要有創新性觀點的形成。3、在論證過程中存在差別：就論證過程來說，學術論文是以“論”成文的，論文作者要運用嚴謹規范的科學語言、形式和專業的術語概念，來論說所持的觀點見解，論證所提出的理論模式，做到就事論理、以理服人，論述深刻、充分，論證嚴密、透徹，論斷精當、公允，論據可靠、確鑿，同時還要有較高的推理成分，具有較強的論理性；而研究報告則注重用事實與數據來說明和揭示某一問題或現象，主要憑事實和數據說話。