北京地鐵13號線部分站點內設有衛生間，具體位置如下：西直門：站內付費區站廳北端，周邊嘉茂各層均設有衛生間；2號線和4號線站內衛生間位置分別為站臺北端和站臺西端。知春路：站內付費區北站廳北端；10號線衛生間位于10號線下行站臺東端。五道口：站內付費區南站廳南端。上地：站內付費區站廳南端。西二旗：13號線外環/上行站臺首端及尾端（西站臺北端及南端），與昌平線共用衛生間。龍澤：站內付費區站廳西側付費區西端；站廳為整體站廳，中間是非付費區，兩側為兩個獨立的付費區。回龍觀：站內付費區站廳西側付費區西端；站廳為整體站廳，中間是非付費區，兩側為兩個獨立的付費區。霍營：站內非付費區出入口小廳東端。立水橋：站內付費區站廳西端；5號線立水橋站衛生間位于5號線下行站臺西側。北苑：站內付費區站廳西側付費區西端；站廳為整體站廳，中間是非付費區，兩側為兩個獨立的付費區。望京西：站內付費區站廳北側付費區北端；15號線衛生間位于站臺東端。芍藥居：站內付費區站廳北側付費區北端；10號線衛生間位于站臺東端。光熙門：站內付費區站廳南側付費區南端。柳芳：站內非付費區A口小廳南端。東直門：13號線外環/上行站臺東側（東站臺東側）；2號線衛生間位于站臺南端，機場線衛生間位于站臺西端。