往來港澳通行證的有效期分為兩種：5年和10年。5年通行證適用于未滿16周歲的申請人，10年通行證則適用于16周歲及以上的申請人。對于往來港澳簽注的類型，主要有探親簽注、商務簽注、團隊旅游簽注、個人旅游簽注以及逗留簽注。探望兄弟姐妹、（外）祖父母、（外）孫子女等親屬，可簽發3個月一次簽注，逗留不超過14天。探望配偶、父母或配偶的父母等，可簽發3個月多次簽注，逗留不超過90天，60周歲及以上人員可簽發1年多次簽注。赴港澳探望配偶且有未成年子女的，可以簽發1年多次簽注。特殊家庭困難的，經省級公安機關出入境管理部門核準，可簽發1年多次簽注。商務簽注分為已備案企業和未備案企業，已備案企業可簽發3個月一次簽注、3個月多次簽注、1年多次簽注，每次逗留不超過7天。未備案企業、個體工商戶經營者及駕駛往返廣東與港澳專門交通工具人員，簽發3個月一次簽注或1年多次簽注，每次逗留不超過7天。團隊旅游簽注分為赴香港和澳門，香港簽注可以簽發3個月一次、3個月二次、1年一次、1年二次簽注，每次逗留不超過7天。澳門簽注可以簽發3個月一次、1年一次簽注，每次逗留不超過7天。個人旅游簽注同樣分為赴香港和澳門，香港簽注可以簽發3個月一次、3個月二次、1年一次、1年二次簽注，每次逗留不超過7天。澳門簽注可以簽發3個月一次、1年一次簽注，每次逗留不超過7天。逗留簽注適用于赴香港或澳門隨任、就學、就業、居留、培訓或作為受養人赴香港依親的人員。赴香港簽注有效期根據香港入境事務處簽發的進入許可最長有效期簽發，持證人需按香港進入許可規定入出香港。赴澳門簽注有效期根據中央人民政府駐澳門特別行政區聯絡辦公室、澳門高等教育輔助辦公室、治安警察局出入境事務廳或勞工事務局、社會文化司批準的期限簽發。其他簽注可根據具體情況簽發3個月一次、3個月二次簽注，特殊情況可簽發3個月多次簽注，每次逗留不超過14天。